Ο Ιωάννης Αθαναηλίδης αποφοίτησε από το Τ.Ε.Φ.Α.Α. Θεσσαλονίκης το 1982. Το 1998 υποστήριξε τη διδακτορική διατριβή με θέμα “Οργάνωση της εκπαίδευσης στην αντισφαίριση”. Από το 1988 έως το 1991 ήταν υπεύθυνος του αναπτυξιακού προγράμματος τένις της ΕΦΟΑ. Από το 1992 έως 1995 ήταν υπεύθυνος οργάνωσης τουρνουά τένις της Λένας Δανιηλίδου στο εξωτερικό. Υπηρετεί ως Επίκουρος καθηγητής στο τμήμα Τ.Ε.Φ.Α.Α. του Δημοκρίτειου Πανεπιστήμιου Θράκης.